El sistema del aula virtual es donde se gestan los documentos, sistemas, entre otros necesarios.
Aula Virtual Institucional: Este es el espacio donde se albergan todos los cursos regulares de la UNA. Si usted es estudiante de Diplomado, Bachillerato, Licenciatura, Maestría o Doctorado y sus profesores utilizan el Aula Virtual.
Aula Virtual de Educación Permanente: Este es el espacio donde se albergan los cursos de educación permanente o educación continua de las diversas instancias de la UNA
Aula Virtual de Actualización Profesional: Este es el espacio donde se albergan los cursos del Sistema de Actualización Profesional, de UNA Virtual y del Área de Formación y Actualización del Talento Humano.
Aula Virtual Investigación y Desarrollo: Es el Aula Virtual donde se pueden realizar proyectos de investigación, los académicos pueden preparar sus cursos y es ahí donde se albergan todos los cursos de la Escuela Ecuménica de Ciencias de la Religión
Aula Virtual Histórico: Este es el espacio donde se albergan los cursos que han estado alojados en el Aula Virtual Institucional durante el año previo al año en curso.